化肥廠所排的污水成分比較復雜，同時也和化肥廠產品和工藝有關。一般氮肥廠廢水中常規污染物有COD、BOD、氨氮、油類、懸浮物，特征污染物有氨氮、揮發酚、硫化物、氰化物等。磷肥廠廢水中常規污染物有COD、BOD、懸浮物，特征污染物有磷酸鹽、氟化物。